Die Forschungsgebiete und die Anwendungsvision der NTH-School für IT-Ökosysteme werden in gemeinsamen Kooperationsprojekten bearbeitet. In jedem Kooperationsprojekt sind Wissenschaftler aus jedem Standort beteiligt. Die Kooperationsprojekte werden von Professorinnen und Professoren aus der Informatik der drei Standorte geleitet. Die unterschiedlichen Forschungsgebiete werden nicht ausschließlich von einem Kooperationsprojekt bearbeitet. Zentrale Forschungsgebiete werden bewusst von mehreren Forschungsprojekten jedoch mit unterschiedlichen Sichtweisen und Ansätzen bearbeitet.